A los tres días del triunfo de la Revolución, José Ramón Fernández, después de regresar de la Isla de Pinos y detener al General Eulogio Cantillo, entregó toda responsabilidad y se fue para su casa. El 12 de enero, Fidel lo citó a su oficina junto a otros oficiales que estuvieron presos por causa de la conspiración contra Batista, iniciada en 1953.En la reunión, Fidel distribuyó algunos puestos y a Fernández le encargó la dirección de la Escuela de Cadetes. Él no contestó. Al finalizar el encuentro, le explicó a Fidel que él no tenía nada en contra de la Revolución, a la cual veía con simpatía y creía en sus proyectos de cambios para el país, pero que su movimiento había fracasado y él no se sentía con méritos, que quienes habían hecho la Revolución debían conducirla. Además dijo, ya tenía en la vida civil trabajo como administrador de un central.